MRJ har ansvaret for:
- Forhandling og implementering af internationale regler
- Koordinering af Søfartsstyrelsens arbejde i internationale organisationer, herunder ILO og IMO (med undtagelse af MEPC)
- Koordinering af Søfartsstyrelsens arbejde med regler for skibsfart i EU
- Maritim sikkerhed, herunder pirateri og cybersikkerhed
- Arktis og koordinering af samarbejdet med Grønland
- Søfartsstyrelsens lovarbejde, herunder udvikling og implementering af regler
- Juridisk rådgivning internt, herunder aktindsigt og forvaltningsret.